Ein anderer Schwerpunkt liegt auf der Analyse von Transportprozessen verschiedener Nutzpflanzen, die insbesondere dem Transport des durch die Photosynthese fixierten Kohlenstoffs aus den Chloroplasten der Blätter dienen. Ein weiteres Ziel besteht darin, die Leistung dieser Pflanzen durch gezielte Veränderung der Aktivitäten der Transportsysteme zu modifizieren und möglicherweise zu steigern.
Eine andere Arbeitsgruppe befaßt sich mit der Struktur und Funktion der Assimilatleitgewebe, insbesondere der Beladung der Transportbahnen und der Entnahme transportierter Substanzen aus den Transportbahnen im Verbrauchsorgan.
Eine weitere Gruppe befaßt sich mit der Ökophysiologie von Sumpf- und Wasserpflanzen. Dazu gehört die Anlage künstlicher Feuchtgebiete mit tropischen Sumpfpflanzen zur Reinigung von Oberflächenwasser. Des weiteren wird die Bedeutung der Flutungstoleranz von Sumpfbäumen für die Regeneration des tropischen Regenwaldes im Hinblick auf eine nachhaltige Nutzung der Überflutungswälder untersucht.
In dem Schwerpunkt Vegetationsökologie wird die zeitliche Veränderung der Pflanzendecke aufgrund verschiedener Nutzung oder Umweltveränderungen untersucht. Im Mittelpunkt stehen hier die Veränderungen der Vegetation in Trockengebieten und Savannen aufgrund von nichtangepaßter Nutzung sowie von globalen Klimaveränderungen.
Reife- und Alterungsprozesse in Pflanzen werden in einer weiteren Arbeitsgruppe bearbeitet. Durch die Erzeugung transgener Pflanzen mit veränderter Protein-Expression wird die Verzögerung der Notreife, die bei Getreide unter Trockenbedingungen zu Ertragsverlusten führt, angestrebt.
Ein weiterer Schwerpunkt liegt in der Zellbiologie, Systematik und Biotechnologie von Mikroalgen. Zwei Arbeitsgruppen beschäftigen sich mit der Lichtorientierung und Signaltransduktion dem Cytoskelett, der Sekretion und der molekularen Systematik und Evolution. In der angewandten Forschung werden neuartige Bioreaktoren entwickelt und die CO2-Anreicherung aus Verbrennungsgasen durch Algen untersucht.
Eine Arbeitsgruppe Signaltransduktion untersucht die molekularen und biochemischen Mechanismen, die die Pflanzen befähigen, den Auf- und Abbau von Photosyntheseprodukten den jeweils herrschenden Lichtbedingungen zupassen. Die große Zahl molekularer Sequenzen, die diese Analyse mit sich bringt, erlaubt es zudem, phylogenetische Zusammenhänge aus der Frühzeit der Landpflanzenevolution zu rekonstruieren.
Die Arbeitsgruppe Biologische Luftreinigung erforscht die Möglichkeit, mit Hilfe von Zimmerpflanzen und den in ihrem Wurzelbereich lebenden Bodenbakterien Luftschadstoffe abzubauen. Aufbauend auf langjährigen Versuchen wurde ein Biofiltergerät für Innenräume entwickelt und patentiert.
In einem weiteren Forschungsbereich werden Produkte des Sekundärstoffwechsels (Phenylpropan- und Flavonoide) untersucht, die potentiell als Schutz gegen UV (B)-Stahlung bei Kulturpflanzen (z.B. Getreide) hohe Bedeutung erlangen könnten. Des weiteren wird über die Entgiftung und Speicherung pflanzeneigener Sekundärstoffe gearbeitet, die auch als Modell zur Entgiftung und Speicherung pflanzenfremder Substanzen (z.B. Herbizide) geeignet sind.