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Die Software im Bereich Chemie wird in enger Kooperation zwischen den
Chemischen Instituten und dem Regionalen Rechenzentrum der
Universität zu Köln bereitgestellt. Die verfügbare
Chemie-Software gliedert sich in Programme für UNIX-Plattformen,
PC- und Apple Macintosh-Programme. Programme der ersten Kategorie
stehen auf UNIX-Maschinen im gesamten UKLAN (Computernetzwerk der
Universität zu Köln) zur Verfügung, die PC-Programme
können z.B. im CIP-Pool der Chemischen Institute und die
Macintosh-Programme z.B. im Mac-Pool des Rechenzentrums benutzt
werden.
Hinweise zur Benutzung der Chemie-Software für UNIX-Plattformen
finden Sie weiter unten. Anleitungen und Informationen zu den anderen
Programmen finden Sie in den jeweiligen Computer-Pools.
Datenbanken und zugehörige Hilfsmittel
-
gOpenMol. Mächtiges
Programm zur Darstellung der Ergebnisse quantenchemischer Berechnungen.
Mölglichkeit zur Animation sind gegeben.
-
Molden Darstellung quantenchemischer
Berechnungen. Versteht eine groß Anzahl von Eingabeformaten. Ausgabeformate
sind unter Anderem postscript, VRML, PovRay.
-
Molekel Visualisierung der Ergebnisse
quantenmechanischer Rechnungen. Hohe Ausgabequalität, Import der
Ausgabedateien verschiedener QC-Pakete, Export von rgb, jpg
und tiff Bildern beliebiger Größe.
Rasmol
ermöglicht die Visualisierung von Proteinen,
Nukleinsäuren und kleinen Molekülen
(Linux, cliot.rrz.uni-koeln.de).
Quantenchemische Berechnungen und molekularmechanische Verfahren
Gaussian03
Semiempirische und ab initio Berechnungen von
Moleküleigenschaften.
(Site license Unix/Linux).
GaussView3
Grafische Benutzeroberfläche für Gaussian
(GV 3.0.9: Site wide Unix/linux,
Vorgägerversion GV 2: Site wide Windows)
Turbomole 6
ab initio Programmpaket (Linux)
Simulationen
- Amber10
Molekulardynamische Simulationen an Biomolekülen (cliot.rrz.uni-koeln,
altix1.rrz.uni-koeln.de).
Konvertierungsprogramme/ Sonstiges
-
PGF77: Portland
Group Parallel Fortran Compiler für Intel-basierte Linux-Systeme
(Unterstützung auch für Solaris86).