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Uni Köln

Zentrum für Angewandte Informatik (ZAIK) / Universitätsweiter Service (RRZK)

Isostar am RRZK

Beschreibung

Isostar wertet die Protein-Datenbank (PDB) und die organische Strukturdatenbank (CSD) aus, um Informationen zu intermolekularen Wechselwirkungen zu erhalten. Die Ergebnisse werden graphisch dargestellt. Ein Hyperlink-Mechanismus führt von den Suchergebnissen mit Isostar direkt zu den Datenbanken CSD und PDB. Deren Einträge werden ebenfalls visualisiert, wobei die an der Wechselwirkung beteiligten Atome farblich hervorgehoben werden.

Die beigefügten Tutorien vermitteln die Grundlagen der Bedienung von IsoStar.

Voreinstellungen

Vor dem ersten Aufruf von Isostar ist es nötig, Netscape zu konfigurieren. Starten Sie netscape auf der campfire und öffnen Sie das Menüfenster:

Options/Preferences, dann Navigator/Applications

sollte sich dort kein Eintrag chemical/x-isostar befinden, legen Sie einen neuen an (Button New).

Hier tragen Sie ein:

• Type: chemical/x-isostar
• Suffix: istr
• Application ankreuzen
• Pfad eintragen: /vol/chemie/share/isostar/bin/isorasmol %s

Aufruf

Isostar ist nur auf der campfire verfügbar, der Start erfolgt mit

/vol/chemie/bin/isostar

Daraufhin startet die HTML-Oberfläche von Isostar in einem Netscape-Fenster. Nach Auswahl der zu untersuchenden intermolekularen Wechselwirkung wird das Programm Isorasmol gestartet.

Evtl. benötigt Isorasmol eine Farbtiefe von 8, 24 oder 32 Bit. Sollte Isorasmol nicht starten, kann die Ursache eine Farbtiefe des X-Servers von 16 Bit sein.

Einführung und Hilfe

Von der Startseite können drei Tutorien und die Hilfe aufgerufen werden. Die Tutorien bieten sich als gute Einführung in die Fähigkeiten von Isostar an. Weiterhin gibt es eine Isostar Homepage.

Lars Packschies Fragen zur Chemiesoftware können Sie auch an chemie-software@rrz.uni-koeln.de richten. Letzte Änderung: 05.12.2008