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Schakal ist ein Programm zur Visualisierung von Molekülen und Gitterstrukturen. Parallel zu Schakal97 läuft auf den Plattformen SUN Solaris (starfire, campfire) und sgi IRIX (sgi1) Schakal99. Für Linux ab Version 2.2 liegt Schakal nur in der neueren 99-er Version vor. Diese Anleitung gilt auch für Schakal97, wobei man dabei einfach die 99 weglässt (also z.B. schakal statt schakal99 oder uschak statt uschak99). Es gibt aber noch eine etwas ältere Anleitung für Schakal97. Der Autor von Schakal, E. Keller, schreibt hier (unter anderem!): "SCHAKAL 99 differs from SCHAKAL 97 mainly by the following items:
Hinzu kommen andere Punkte, wie verbesserte Rotations- und Flip- Funktionen oder die Möglichkeit zur Integration eigener Kommandos in die Benutzeroberfläche. Die Einrichtung von Schakal99 erfolgt analog zur Vorgängerversion. Einrichtung von Schakal99Vor dem ersten Aufruf ist es notwendig, ein Arbeitsverzeichnis, in dem sich einige Schakal-spezifische Dateien befinden müssen, zu erstellen. Wechseln Sie in das Verzeichnis, unter welchem das "Schakal-Systemverzeichnis" angelegt werden soll. Beispiel: Schakal soll im Verzeichnis $HOME/schakal/sch99 ($HOME entspricht der Tilde "~", also "~/schakal/sch99") installiert werden Wechsel in das eigene home-Verzeichnis: cd ~ erzeugen des Verzeichnisses $HOME/schakal: mkdir schakal und Wechsel dorthin: cd schakal mit pwd kann man überprüfen, ob man sich in diesem Verzeichnis befindet. Von $HOME/schakal aus wird die Initialisierung von Schakal99 mit dem Befehl /vol/chemie/bin/uschak99 angestoßen. Es wird nach einem frei wählbaren Verzeichnisnamen gefragt. Hier also sch99 Anschließend werden die benötigten Dateien in dieses Verzeichnis kopiert. Hierin wird (unter anderem) ein weiteres Unterverzeichnis sch99.dat/ erstellt, in dem die Schakal-Inputfiles mit den Atomlagen abgelegt werden (*.dat). In der Datei schakal/sch99/sch99.ini können die benutzerspezifischen Pfade gegebenenfalls angepaßt werden. Sind diese Vorarbeiten einmal erledigt, so kann Schakal99, nach dem Wechsel in das Arbeitsverzeichnis sch99, wie folgt aufgerufen werden:/vol/chemie/bin/schakal99 BenutzungAlle Befehle können in der Schakal-Textkonsole oder per Menü eingegeben werden. Über die vielfältigen Möglichkeiten informiert das Handbuch (s.u.). Eine typische Schakal-Sitzung sei im folgenden erläutert:
PC-VersionAuf Anfrage ist bei den Betreuern eine PC-Version von Schakal99 erhältlich. Hierbei sind Versionen für die Betriebssysteme Windows 3.x, Windows 95/98/NT und Linux verfügbar. Dokumentation und HilfeHandbücherOnline-Manual Alle Befehle, die in der (deutschen) Manpage der Vorgängerversion 92 beschrieben sind, können im Textfenster der Version 97/99 weiterhin verwendet werden. Zur Laufzeit des Programmes kann weiterhin das Online-Manual aufgerufen werden. Hierzu gibt man lediglich "0" im Textfenster ein. Diese Informationen sind auch als Textfile erhältlich:
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